公司破产清算不够支付员工赔偿时，应当根据比例分配。根据《企业破产法》第一百一十三条第一款、第二款的规定，破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：

破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金；

破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款；

普通破产债权。破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。

法律依据：

《企业破产法》第一百一十三条第一款、第二款破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：

（一）破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金；

（二）破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款；

（三）普通破产债权。破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。

公司破产清算是什么意思？

破产清算是指法院宣告股份有限公司破产后，由清算组接管该公司，对破产公司财产进行清算、评估、处理和分配。清算组按照人民法院有关法律的规定，由股东、有关主管部门和有关专业人员组成。所谓相关机构一般包括国有资产管理部门、政府主管部门、证券管理部门等，专业人员一般包括会计师、律师、估价师等。