1、二者购买、赎回的方式不同：母基金并不是每天都可以购买赎回，会根据不同券商来确定开放交易日，在其他时间无法买卖。子基金购买赎回的时间更加灵活，购买只基金后通常会有一定的封闭期，只要过了基金封闭期都可以进行交易，买入或者赎回。

2、二者产生的手续费不同：母基金收取的手续费要高于子基金，因为母基金投资产品是基金，从而会出现双重费用的情况，基金产品会产生一定手续费，以基金为标的的母基金又会收取一定费用。子基金通常是以股票，债券为投资标的，只会收取一次手续费。

3、投资风险不一样：母基金购买的是一个组合的产品，因此交易的风险更小，同时收益也比较低。但是只基金通常是直接投资于股票或者债券等，股票型基金的风险非常高。

4、二者购买起点不同：母基金因为是一个整体，所以购买的起点要高于子基金；子基金作为母基金拆分的一部分购买起点要更低。