两者的区别主要有开证主体不同、到期兑付情况不同、开票需资金到位情况不同。

①开证主体不同：商业汇票是一种由企业出具的承兑汇票，而银行汇票就是银行出具的汇票。

②到期兑付情况不同：有企业签发的商业汇票，当汇票到达期限时可以由银行以外的付款人支付给收款人或者是持款人。银行汇票到期以后，是由银行按照规定进行支付的。

③开票需资金到位情况不同：商业汇票企业存入银行的钱不能够进行支付汇票的票面金额的话，银行可以对收款进行足额支付，然后银行再向企业索要资金的赔偿。而银行汇票是需要付款人先把金钱存入到银行卡内，银行才会开具汇票。

商业汇票要计入什么科目？

商业汇票计入应付票据科目。企业到期收回货款或背书转让，记入贷方;取得已承兑的商业汇票时，记入借方;表示企业应收票据款的结存数额，期末账户余额在借方。