如果公司已经申报了个人所得税但没有支付相应的税款，可以按照以下步骤来处理此问题：

1、确定逾期原因：首先要弄清楚为什么税款没有按时支付。可能的原因包括疏忽、遗漏、资金短缺等。

2、查看逾期天数：了解个人所得税申报的截止日期，计算已经逾期支付的天数。

3、了解逾期罚款：查询相关税收法规，了解逾期支付税款将面临怎样的罚款或利息。

4、尽快支付：尽快支付欠缴的税款以及可能产生的罚款或利息，避免欠缴税款时间过长，导致更严重的法律责任。

5、做好记录：对于此次逾期支付的原因，整理相关记录，以便对公司的财务管理进行改进，避免类似问题再次发生。

6、与税务部门沟通：可以主动联系税务部门，了解逾期支付的相关处理方式，看是否可以申请减免罚款等。需要注意的是，在我国一般情况下很难申请减免税收滞纳金。

在处理完逾期支付的问题后，您应该加强与税务部门的沟通，确保未来个人所得税申报和缴纳工作按时完成。同时，加强公司内部的财务管理，防止类似问题再次发生。

个人所得税申报什么意思？

个人所得税申报是指个人年度收入达到国家规定的交税起征点时，需要在规定的时间内申报个税并进行缴纳。个人所得税按年计算，每月或每季度结束后的十五日内，个人需要向税务机关报送纳税申报表，并预缴税款。